En articulation avec ces axes de recherche, l'ENVN ancre ses formations de 3ème cycle dans un partenariat avec l'Ecole Doctorale "Chimie - Biologie" de l'Université de Nantes et avec celle "Vie – Agronomie – Santé" de l' Université de Rennes. Elle se mobilise vers le nouveau contexte éducatif européen en proposant des Masters recherche et des Masters professionnels.

Masters Recherche

- Master "Sciences Biologiques et médicales"
Spécialité "Biologie, Biotechnologie et Recherche Thérapeutique"

- Master "Sciences Chimiques et Ingénierie
Spécialité "Chimie du vivant aux matériaux

- Master "Biologie"
Spécialité "Biologie, productions animales et qualité"



Masters Professionnels

- Master Management
Spécialité " Marketing des produits et services de santé"

- Master "Ingénierie Chimique et Agro-alimentaire"
Spécialité "Risques Chimiques & Biologiques dans l'Entreprise"
Spécialité "Maîtrise & Management de la Qualité dans les Industries Agro-Alimentaires

- Master "Sciences agronomiques et agro-alimentaires"
Spécialité "Sciences Halieutiques et Aquacoles"