Le Centre recueille et soigne des animaux sauvages en détresse en vue de leur réhabilitation dans le milieu naturel. Les animaux (90 % d'oiseaux, 10 % de mammifères) proviennent de la Région Pays de la Loire et de ses environs. De quelques dizaines d'animaux recueillis les premières années (18 en 1985), le Centre en recueille actuellement plusieurs centaines (1 114 en 2004).

Le Centre accueille au quotidien des animaux victimes de traumatismes physiques (accidents de la route, électrocution, chasse, .), d'intoxications par des agents chimiques et biologiques (pesticides, hydrocarbures, toxine botulinique, .), d'affections liées à la présence d'agents pathogènes (bactéries, virus, parasites) et de dénichage.

Le Centre intervient lors de catastrophes écologiques telles les marées noires (ERIKA, 11 000 oiseaux accueillis ; PRESTIGE, 350 oiseaux accueillis) ou les épisodes de botulisme sur les zones humides régionales (Lac de Grand-Lieu, Marais de Goulaine,.).